ملاک های اساسی:

توسعه دانش محور

خلاقیت و نوآوری

اخلاق پزشکی و اسلامی مخصوصا اخلاق در پژوهش و مالکیت معنوی

ایجاد ثروت از دانش

کرامت و حقوق انسان

برنامه‌های کلان:

1.       تدوین مدیریت‌های کلان سازمانی

2.       تبیین ساختار اداری مرکز تحقیقات

3.       ارتقاء ارتباطات علمی با مراکز بین‌المللی

4.       افزایش مراودات با مراکز علمی داخلی و صنعتی

5.       ایجاد سازوکارهای آموزش‌های تخصصی و همگانی

6.       نیازسنجی دوره‌ای سلامت جامعه در بیماری‌های عفونی

7.       ارتقاء کیفی و کمی منابع انسانی تخصصی و ماهر

8.       مشارکت در تصمیم سازمان‌های کلان سلامت مرتبط با بیماری‌های عفونی

9.       پیشگامی در تولید و توسعه فن‌آوری و دانش مرتبط با بیماری‌های عفونی